Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col25a1Q99MQ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col25a1Q99MQ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col25a1Q99MQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms