Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms