Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cstf3Q99LI7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cstf3Q99LI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms