Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp16Q99LG0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp16Q99LG0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp16Q99LG0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms