Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q99KU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q99KU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q99KU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q99KU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q99KU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q99KU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q99KU6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q99KU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q99KU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q99KU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q99KU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q99KU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q99KU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q99KU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q99KU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q99KU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q99KU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q99KU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q99KU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q99KU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q99KU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q99KU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q99KU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q99KU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q99KU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q99KU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q99KU6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q99KU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q99KU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q99KU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q99KU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q99KU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q99KU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q99KU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q99KU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q99KU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q99KU6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q99KU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q99KU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q99KU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q99KU6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q99KU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q99KU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q99KU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q99KU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q99KU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q99KU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q99KU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q99KU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q99KU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q99KU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q99KU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms