Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf34Q99KR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms