Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ciao1Q99KN2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ciao1Q99KN2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ciao1Q99KN2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms