Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab28Q99KL7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab28Q99KL7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms