Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dok4Q99KE3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dok4Q99KE3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dok4Q99KE3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dok4Q99KE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms