Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp11Q99K46 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp11Q99K46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms