Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EpcamQ99JW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EpcamQ99JW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms