Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lims1Q99JW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lims1Q99JW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms