Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfxn1Q99JR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfxn1Q99JR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfxn1Q99JR1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms