Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx58Q99J87 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx58Q99J87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx58Q99J87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms