Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg5Q99J83 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg5Q99J83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg5Q99J83 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg5Q99J83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg5Q99J83 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg5Q99J83 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg5Q99J83 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg5Q99J83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms