Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec3Q99J72 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec3Q99J72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec3Q99J72 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms