Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc8b1Q925Q3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc8b1Q925Q3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms