Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfdQ925I7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfdQ925I7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfdQ925I7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PdgfdQ925I7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfdQ925I7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms