Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1l1Q923U0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tom1l1Q923U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1l1Q923U0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1l1Q923U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tom1l1Q923U0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1l1Q923U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tom1l1Q923U0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 427.5 ms