Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sirt1Q923E4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Sirt1Q923E4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sirt1Q923E4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sirt1Q923E4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms