Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NelfcdQ922L6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NelfcdQ922L6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfcdQ922L6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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