Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi2Q920Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msi2Q920Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msi2Q920Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms