Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FdpsQ920E5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FdpsQ920E5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FdpsQ920E5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms