Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpe65Q91ZQ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpe65Q91ZQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpe65Q91ZQ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms