Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6cQ91ZQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6cQ91ZQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde6cQ91ZQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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