Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha5Q91Y15 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha5Q91Y15 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms