Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y02

Pcdhb18, Protocadherin beta-18, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb18Q91Y02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdhb18Q91Y02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb18Q91Y02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb18Q91Y02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb18Q91Y02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms