Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trub2Q91WG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trub2Q91WG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trub2Q91WG3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms