Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd3Q91WC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd3Q91WC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Setd3Q91WC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms