Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col26a1Q91VF6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col26a1Q91VF6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col26a1Q91VF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col26a1Q91VF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms