Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApofQ91V80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms