Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crb1Q8VHS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crb1Q8VHS2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms