Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms