Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cul7Q8VE73 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cul7Q8VE73 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cul7Q8VE73 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Cul7Q8VE73 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms