Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam20bQ8VCS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam20bQ8VCS3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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