Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn4Q8VCH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn4Q8VCH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms