Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh10Q8VCH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh10Q8VCH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdh10Q8VCH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh10Q8VCH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh10Q8VCH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms