Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmprss4Q8VCA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmprss4Q8VCA5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmprss4Q8VCA5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmprss4Q8VCA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms