Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alas1Q8VC19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Alas1Q8VC19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Alas1Q8VC19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alas1Q8VC19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms