Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clptm1Q8VBZ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clptm1Q8VBZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clptm1Q8VBZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clptm1Q8VBZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clptm1Q8VBZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clptm1Q8VBZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clptm1Q8VBZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms