Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc12Q8R344 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc12Q8R344 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc12Q8R344 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc12Q8R344 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms