Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0Y6

Aldh1l1, Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1l1Q8R0Y6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aldh1l1Q8R0Y6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aldh1l1Q8R0Y6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Aldh1l1Q8R0Y6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms