Protein–RNA interactions for Protein: Q8R092

Uncharacterized protein C1orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R092 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8R092 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8R092 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R092 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R092 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R092 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R092 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R092 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8R092 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R092 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R092 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R092 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R092 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R092 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R092 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R092 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R092 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R092 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R092 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R092 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms