Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paf1Q8K2T8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paf1Q8K2T8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Paf1Q8K2T8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms