Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trappc12Q8K2L8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc12Q8K2L8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc12Q8K2L8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms