Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brd3Q8K2F0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd3Q8K2F0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms