Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf3Q8K268 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf3Q8K268 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms