Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam20aQ8CID3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20aQ8CID3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20aQ8CID3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms