Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Clip4Q8CI96 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Clip4Q8CI96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clip4Q8CI96 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Clip4Q8CI96 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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Clip4Q8CI96 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Clip4Q8CI96 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clip4Q8CI96 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip4Q8CI96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip4Q8CI96 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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