Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog3Q8CI04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog3Q8CI04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog3Q8CI04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms